Procesy restrukturyzacji odbywające się w ciągu roku wymagają weryfikacji obowiązków podatkowych każdego z podmiotów uczestniczących w procesach. Osoby prawne przejmujące lub osoby prawne powstałe w wyniku podziału wstępują, z dniem podziału lub z dniem wydzielenia, we wszelkie przewidziane w przepisach prawa podatkowego prawa i obowiązki osoby prawnej dzielonej pozostające w związku z przydzielonymi im, w planie podziału, składnikami majątku (art. 93c § 1 Ordynacji podatkowej).

W przypadku podziału przez wydzielenie decydujące znaczenie ma okoliczność, czy dany obowiązek powstał lub istniał przed dniem wydzielenia. Możliwa jest sytuacja, kiedy rejestracja podziału (dzień wydzielenia) nastąpi w styczniu, jeszcze przed upływem ustawowego terminu na złożenie deklaracji na podatek od nieruchomości (31 stycznia) oraz przed płatnością pierwszej raty podatku.

Wówczas, jeśli dzień wydzielenia następuje przed dniem, na który przypada obowiązek złożenia deklaracji oraz przed dniem zapłaty części podatku, to spółka przejmująca, zgodnie z art. 93c Ordynacji podatkowej, powinna złożyć deklaracje oraz zapłacić podatek za cały 2026 rok od nieruchomości. Następca prawny wstępuje w miejsce zbywcy z wszelkimi tego konsekwencjami. Od dnia wydzielenia spółka istniejąca przed podziałem, nie jest już posiadaczem przekazanych nieruchomości i nie wykorzystuje ich w działalności.

W przypadku wnoszenia wkładu niepieniężnego (aportu) podatnikiem podatku od nieruchomości jest spółka otrzymująca aport. Wnoszący aport składa korektę DN-1, a spółka obejmująca nieruchomość składa nową deklarację DN-1 w terminie 14 dni.

Przedsiębiorca będący osobą fizyczną opłaca podatek na podstawie decyzji organu (po złożeniu informacji IN-1). Po przekształceniu w spółkę kapitałową zmienia się tryb rozliczeń na samodzielne opodatkowanie – nowa spółka musi samodzielnie złożyć deklarację DN-1 w ciągu 14 dni od wpisu do KRS i wpłacać raty bez wezwania do 15. dnia każdego miesiąca.

W księgach rachunkowych podatek od nieruchomości odnosi się w ciężar kosztów działalności operacyjnej jednostki, na konto kosztów rodzajowych 403 „Podatki i opłaty” bądź na odpowiednie konto zespołu 5, zapisem: Wn konto 403, Ma konto 22 „Rozrachunki publicznoprawne”. W sytuacji, gdy podatek od nieruchomości dotyczy nieruchomości inwestycyjnej, księguje się go na konto 761 „Pozostałe koszty operacyjne”.

W przypadku podziału spółki (np. przez wydzielenie lub wyodrębnienie) pełne przejście praw (w tym do nadpłat) i obowiązków związanych z nieruchomością na spółkę przejmującą następuje tylko wtedy, gdy majątek pozostający w spółce dzielonej oraz majątek przejmowany stanowią zorganizowaną część przedsiębiorstwa (ZCP). Jeśli wydzielana jest sama nieruchomość (niestanowiąca ZCP), podatek od kolejnego miesiąca płaci nowy właściciel, ale prawa do powstałych wcześniej nadpłat zostają w spółce dzielonej.