Procesy restrukturyzacyjne podmiotów wymagają przeprowadzenia pogłębionej analizy podatkowej przed ich rozpoczęciem. Nie każde przekształcenie czy połączenie umożliwi kontynuację stosowania preferencji podatkowych podmiotu, który istniał przed rozpoczęciem reorganizacji.

Przepisy ustawy o CIT ani innych ustaw, umowy o unikaniu podwójnego opodatkowania oraz inne ratyfikowane umowy międzynarodowe, których stroną jest Polska nie przewidują sytuacji, w której podatnik będący spółką przejmującą wstępującą w pełnię praw i obowiązków podatkowych spółki przejmowanej w wyniku sukcesji uniwersalnej mógłby zostać pozbawiony prawa do rozliczania się w uproszczonej formie.

Po połączeniu spółka przejmująca będzie traktowana jako kontynuator prawny spółki przejmowanej i w związku z tym będzie w całości kontynuować rozliczenia podatku CIT. Po dniu połączenia do końca roku podatkowego, podatnik będzie uprawniony opłacać zaliczki na podatek dochodowy od osób prawnych w uproszczonej formie w wysokości, w jakiej będą one opłacane od początku roku podatkowego zaczynającego się 1 stycznia do dnia połączenia, tj. bez uwzględniania zaliczek na podatek dochodowy od osób prawnych spółek przejmowanych. Wskazuje na to m.in. interpretacja Dyrektora KiS z 20 listopada 2024 r., sygn. 0114-KDIP2-2.4010.519.2024.1.AP. Spółka Przejmująca powinna ustalić wysokość uproszczonych zaliczek w podatku CIT opłacanych w 2025 r. na podstawie swojego zeznania podatkowego, o którym mowa w art. 27 ust. 1 ustawy o CIT za rok podatkowy zakończony 31 grudnia 2023 r., które zostało złożone przez nią w 2024 r.

Natomiast zmiana wysokości zaliczki na CIT opłacanej w uproszczonej formie może nastąpić w przypadku:

• złożenia przez podatnika korekty zeznania, o którym mowa w art. 27 ust. 1, powodującą zmianę wysokości podstawy obliczenia miesięcznych zaliczek płaconych w uproszczonej formie;
• gdy właściwy organ podatkowy określi należny podatek dochodowy w wysokości innej niż wykazana w zeznaniu, o którym mowa w art. 27 ust. 1, albo w zeznaniu korygującym.

Gdyby zdarzenie połączenia przez przejęcie miało mieć wpływ na kwotę zaliczki uproszczonej opłacanej przez spółkę przejmującą, to taki przypadek zostałby enumeratywnie wymieniony w przepisach art. 25 ustawy o CIT.

Niestety takiej możliwości rozliczania zaliczek uproszczonych nie będzie miała spółka z o.o. powstała w wyniku przekształcenia przedsiębiorcy prowadzącego jednoosobową działalność gospodarczą. Wynika to z faktu, że spółka kapitałowa jest odrębnym od przedsiębiorcy podatnikiem i podlega opodatkowaniu podatkiem dochodowym od osób prawnych a nie jak dotychczas przedsiębiorca – podatkiem dochodowym od osób fizycznych.

Jeśli zaś połączenie dotyczy spółek na estońskim CIT, temat zaliczek uproszczonych nie ma znaczenia, gdyż nadal po reorganizacji można kontynuować zasady rozliczania zryczałtowanego dochodu i składać zeznanie CIT-8E.